收样指南汇总3.0
Blood
03 \ 血液收集指南
血浆
一、基因组
1. 甲基化测序(RRBS、BSAS)
1.1. 采集外周血,迅速转入 EDTA 或枸橼酸钠抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
1.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g离心
10 分钟;
1.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(≥ 2 mL/sample);
1.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
2. 全基因组测序
2.1. 采集外周血,迅速转入 EDTA 或枸橼酸钠抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
2.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10 分钟;
2.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(≥ 2 mL/sample);
2.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
3. 全外显子组测序
3.1. 采集外周血,迅速转入 EDTA 或枸橼酸钠抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
3.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10 分钟;
3.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(≥ 2 mL/sample);
3.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
二、转录组
1. 采集外周血,迅速转入 EDTA 抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心 10
分钟;
3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存管
中;
4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
三、蛋白组
1. TMT
1.1. 采集外周血,迅速转入抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
1.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10分钟;
1.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(0.1-1ml/sample);
1.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
2. Label free
2.1. 采集外周血,迅速转入抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
2.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10 分钟;
2.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心10分钟,小心吸取上清到冻存
管中(50-500ul/sample);
2.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
3. 磷酸化蛋白组学
3.1. 采集外周血,迅速转入抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
3.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10 分钟;
3.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(0.2-2ml/sample);
3.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
4. 糖基化蛋白组学
4.1. 采集外周血,迅速转入抗凝管中,涡旋或用移液器 Tip 混匀;
4.2. 在 1 小时(室温条件下)或 2 小时(4℃条件下)内进行以下操作:4℃,820g 离心
10 分钟;
4.3. 吸取上清转至洁净的离心管中,16,000g, 4℃,离心 10 分钟,小心吸取上清到冻存
管中(0.5-5ml/sample);
4.4. 液氮速冻后放入-80℃冰箱中保存。
四、代谢组
1. 使用肝素钠抗凝管采集全血,并尽快进行血浆分离;
2. 1300g 室温离心 10 分钟;
3. 取上层至冻存管中,液氮速冻后-80℃冰箱保存( NMR 实验 500ul/sample,GC-MS,
LC-MS 实验 200ul/sample);
提示点:
1)代谢组学实验检测推荐使用肝素钠抗凝管,柠檬酸是 TCA 循环中的重要物质,
使用柠檬酸钠抗凝剂的话会引入外源污染。而 EDTA 会影响 NMR 采谱。但肝素钠会
对 RNA 相关实验有负面作用,主要是因为会抑制反转录酶活性。请根据自身具体情
况选用合适的抗凝管;
2)血浆参考产率:≈ 50%(例如:1mL 全血大约能得 0.5mL 血浆)。
五、蛋白芯片
样品量要求:200ul/sample。注意:一定避免反复冻融。
样本收集步骤:
应使用EDTA抗凝管采集全血,并尽快进行血浆分离:3000rpm室温离心10分钟,取上层,0.2mL/管分装至1.5mL离心管中。-80度冻存。足量干冰寄送。
注意事项:
1)血浆参考产率:≈50%(例如:1mL全血大约能得0.5mL血浆)